В феврале 1942 года ГКО принял меры для внесения ясности в структуру управления железнодорожно-восстановительными работами, упразднив представителей НКПС при фронтах. После этого, хотя начальники фронтовых УВВР официально продолжали подчиняться ГУВВР НКПС, в действительности они перешли в подчинение фронтов. Однако НКПС все еще определял объем требуемых фронтами ресурсов, устанавливал квоты работ УВВР и регулировал выделение ресурсов НКПС в соответствии с планами командующих фронтами. Эта мера улучшила управление и техническое качество железнодорожно-восстановительных работ и привела к постепенному росту темпов и качества восстановления железнодорожных путей.112

В целях дальнейшего улучшения организации и координации работы транспорта после зимней кампании 1941–1942 годов Политбюро 14 февраля учредило при ГКО специальный Транспортный комитет, составленный из ключевых хозяйственных и военных руководителей, чья деятельность касалась вопросов транспорта и коммуникаций. Задача этого комитета, работавшего под председательством Сталина, заключалась в координации действий всех видов транспорта, обеспечении более действенного планирования и регулировании как военного, так и всесоюзного хозяйственного транспорта путем мобилизации и рационализации всех видов транспорта, усовершенствовании управления транспортными ресурсами и изменении работы УПВОСО для укрепления его связи с Генеральным штабом.113

После этого У ПСОВ О в дополнение к планированию и управлению всеми военными перевозками стал еще и рабочим органом Транспортного комитета ГКО, отвечающим за организацию и ведение военных перевозок, разработку транспортных сообщений и реагирование на требования о выделении транспорта, подаваемые от других наркоматов. Как представитель ГКО, начальник УПВОСО Ковалев мог теперь более эффективно организовывать транспортировку военных грузов.

В начале 1942 года ГКО также привел в более рациональный виду свою дорожно-транспортную систему, покончив с двойной ответственностью НКО и НКВД за охрану и ремонт дорог. Сделал он это 8 мая, реорганизовав Главное автодорожное управление (ГАДУ) УПВОСО в Главное управление автотранспортной и дорожной службы Красной Армии или ГУАДСКА[87]. На это новое главное управление была возложена ответственность за надзор за всем дорожным транспортом и дорожными службами, органами эвакуации и технического обеспечения в действующих фронтах и армиях ему также оказались подчинены все войска охраны дорог НКВД.114 Кроме того, ГУАДСКА также унаследовало связанные с ГАДУ управления и отделы во фронтах и армиях, а также многие управления и базы дорожной службы НКВД в действующих фронтах.115 Для завершения этого процесса 22 мая НКО подчинил автодорожные управления и отделы ГУАДСКА во фронтах и армиях начальникам служб тыла фронтов и армий в соответствующих фронтах и армиях.116

В 1943 году ГКО и Ставка продолжали совершенствовать транспортные сообщения Красной Армии. Наиболее важный шаг в этом процессе был сделан 31 января, когда Ставка реорганизовала УПВОСО в Центральное управление военных сообщений или ЦУП ВОСО*, вывела его из-под власти начальника тыла и передала Генштабу, а также создала во фронтах, военных округах и армиях отделы военно-транспортных сообщений, подчинявшиеся начальникам соответствующих штабов.117 Однако, поскольку эта структура военно-транспортных сообщений не заработала должным образом, 7 мая НКО вывел ЦУП ВОСО и связанные и ним отделы во фронтах и армиях из-под контроля Генштаба и передал их под общее руководство начальника тыла Красной Армии и заместителей командующих службами тыла во фронтах и армиях. Кроме того, НКО усилил ЦУП ВОСО и реорганизовал его, разделив на специальные отделы, отвечавшие за общее планирование, оперативные перевозки, перевозки военного имущества (боеприпасы, оружие и снаряжение, горюче-смазочные материалы, интендантское имущество и продовольствие), медицинскую эвакуацию и другие менее важные задачи.